SINOVAC科兴依据中国及世界卫生组织（WHO）药品生产质量管理规范（GMP）、ICHQ10 制药质量系统等建立了从药品研发、技术转移、商业化生产在内的覆盖整个产品生命周期的质量管理体系。

SINOVAC科兴甲肝灭活疫苗孩尔来福®、Sabin株脊灰质炎灭活疫苗、水痘减毒活疫苗先后通过WHO预认证(中国共9款疫苗通过WHO预认证)，新型冠状病毒灭活疫苗克尔来福®列入WHO紧急使用清单 (中国共3款疫苗列入该清单)； SINOVAC科兴旗下北京科兴质控实验室和科兴中维质控实验室均获中国合格评定国家认可委员会(CNAS)颁发的实验室认可证书。